1. Вариант с разрушенной цитаделью не катит, так как, во всех трех концовках её восстанавливают.
2. В кодексе сказано что исследовано лишь сотая часть галактики, поэтому с появление новых рас все понятно.
3. На счет жнецов не спорю, однако чьи руины будем исследовать? С жнецами и протеанами все уже ясно, а от более старых рас, стараниями жнецов, почти ничего не осталось.