Да какой может быть сиквел после трех разноцветных концовок? Тут возникают две проблемы.
Если разработчики возьмут за основу, к примеру, красную концовку, получается, что плевать они хотели на выбор всех фанатов, которые могли выбрать синию или зеленую, плевать в той самой франшизе, где основа сюжета строится на выборах главного героя! И пусть даже большинство выборов иллюзорно, и пусть даже в конце концов мы всегда приходим к трем концовкам, сказать фанатам в лицо, что за эталон взята лишь одна концовка, будет, как минимум, неуважением к выборам большинства игроков. Все то, что делал наш герой, может быть уже позабыто в следующей части.
Вторая проблема. Нельзя будет развить каждую концовку. После того как произошло слияние органиков и синтетиков, должен с ног до головы пометься весь концепт игры. Развивать одновременно три концовки будет непосильно БВ.
Параллельное повествование. Отличный выбор. Где ж будет столько же событий, напряженности, как не перед концом света? Недолгая война Первого контакта нервно курит в сторонке. Кто знает, вдруг нам расскажут историю какого-нибудь засекреченного солдата N7, который внес немалый вклад в борьбу со жнецами, о чьем подвиге никто не узнал?