А, то есть это личные выводы все-таки. Хорошо, значит я все-таки не пропустила ничего.
Project of a lifetime мог подразумеваться ее проект (с точки зрения арасаковского ученого, конечно). Как по мне - ее загрузили в сеть так же, как туда загружаются вудуисты - с полным погружением в киберпространство, чтобы она для них там что-то сделала. Скажем, под угрозой убить ее или, например, того же Джонни. А Джонни вытащил штекер (ученый, который мог бы его остановить, лежал мертвый) и запер ее там - к этому относится реплика Альт-ИИ, что это Джонни считает что он ее спасал, а на самом деле он ее скорее убил. Ну и за 57 лет в киберпространстве она перестала воспринимать себя как ту Альт, которая попала в сеть в 2013. Но пользуется ее обликом сейчас, чтобы говорить с Джонни и Ви.
По их диалогу вообще возникает ощущение, что на момент 2013 года соулкиллер возможно вообще еще не работал так, как в 2020, когда Джонни стерли - Арасака его дописали позже, тогда же и Микоши сделали
В целом, это не принципиальный момент для сюжета, мне просто интересно было как местная "Матрица" у них работает. Вудуисты туда грузятся уж больно похоже на реально Матрицу из фильма.